Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms