Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF148Q8N7C7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RNF148Q8N7C7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RNF148Q8N7C7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RNF148Q8N7C7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RNF148Q8N7C7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RNF148Q8N7C7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms