Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms