Protein–RNA interactions for Protein: Q86UX7

FERMT3, Fermitin family homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT3Q86UX7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERMT3Q86UX7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms