Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms