Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms