Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP12Q6UXS9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms