Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms