Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms