Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSAPQ6IQ19 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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