Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD40Q6AI12 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms