Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L3Q68CJ9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms