Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms