Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNT1Q5JUK3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms