Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms