Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms