Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP5B1Q2VPB7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP5B1Q2VPB7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP5B1Q2VPB7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AP5B1Q2VPB7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms