Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms