Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CA9Q16790 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CA9Q16790 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CA9Q16790 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CA9Q16790 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CA9Q16790 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CA9Q16790 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CA9Q16790 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CA9Q16790 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CA9Q16790 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CA9Q16790 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CA9Q16790 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CA9Q16790 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CA9Q16790 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CA9Q16790 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CA9Q16790 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CA9Q16790 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CA9Q16790 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CA9Q16790 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CA9Q16790 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CA9Q16790 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CA9Q16790 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CA9Q16790 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CA9Q16790 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CA9Q16790 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CA9Q16790 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CA9Q16790 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CA9Q16790 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CA9Q16790 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CA9Q16790 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CA9Q16790 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CA9Q16790 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CA9Q16790 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CA9Q16790 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CA9Q16790 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CA9Q16790 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CA9Q16790 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CA9Q16790 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CA9Q16790 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CA9Q16790 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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CA9Q16790 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CA9Q16790 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CA9Q16790 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CA9Q16790 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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CA9Q16790 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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CA9Q16790 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CA9Q16790 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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CA9Q16790 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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CA9Q16790 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CA9Q16790 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CA9Q16790 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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CA9Q16790 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CA9Q16790 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CA9Q16790 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CA9Q16790 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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CA9Q16790 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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CA9Q16790 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA9Q16790 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA9Q16790 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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CA9Q16790 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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CA9Q16790 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA9Q16790 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA9Q16790 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA9Q16790 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA9Q16790 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA9Q16790 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA9Q16790 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA9Q16790 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA9Q16790 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA9Q16790 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA9Q16790 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA9Q16790 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA9Q16790 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA9Q16790 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA9Q16790 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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