Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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