Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms