Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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BRD3Q15059 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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BRD3Q15059 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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BRD3Q15059 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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BRD3Q15059 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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BRD3Q15059 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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BRD3Q15059 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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BRD3Q15059 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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BRD3Q15059 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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