Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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