Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR3Q13615 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR3Q13615 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR3Q13615 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR3Q13615 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR3Q13615 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR3Q13615 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR3Q13615 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR3Q13615 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR3Q13615 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MTMR3Q13615 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR3Q13615 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR3Q13615 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR3Q13615 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR3Q13615 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR3Q13615 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR3Q13615 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR3Q13615 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR3Q13615 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR3Q13615 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR3Q13615 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR3Q13615 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR3Q13615 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTMR3Q13615 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTMR3Q13615 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTMR3Q13615 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MTMR3Q13615 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTMR3Q13615 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTMR3Q13615 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MTMR3Q13615 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MTMR3Q13615 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MTMR3Q13615 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTMR3Q13615 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTMR3Q13615 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTMR3Q13615 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
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