Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAMK2DQ13557 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms