Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TUBB3Q13509 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBB3Q13509 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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