Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTK7Q13308 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms