Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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GPS1Q13098 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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GPS1Q13098 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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GPS1Q13098 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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GPS1Q13098 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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GPS1Q13098 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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GPS1Q13098 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPS1Q13098 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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