Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CNTN1Q12860 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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