Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD3Q0VAK6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms