Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms