Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CD164Q04900 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms