Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms