Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms