Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHDQ02161 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHDQ02161 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHDQ02161 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHDQ02161 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHDQ02161 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHDQ02161 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHDQ02161 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHDQ02161 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RHDQ02161 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHDQ02161 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHDQ02161 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHDQ02161 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHDQ02161 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHDQ02161 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHDQ02161 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHDQ02161 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHDQ02161 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHDQ02161 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHDQ02161 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHDQ02161 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHDQ02161 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHDQ02161 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHDQ02161 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHDQ02161 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHDQ02161 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RHDQ02161 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RHDQ02161 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RHDQ02161 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RHDQ02161 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RHDQ02161 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RHDQ02161 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RHDQ02161 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RHDQ02161 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHDQ02161 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHDQ02161 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHDQ02161 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHDQ02161 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHDQ02161 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHDQ02161 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHDQ02161 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHDQ02161 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHDQ02161 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHDQ02161 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms