Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM3Q01628 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms