Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB1P62873 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB1P62873 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB1P62873 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GNB1P62873 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GNB1P62873 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GNB1P62873 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GNB1P62873 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GNB1P62873 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms