Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB2AP61019 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms