Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms