Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELLP55199 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELLP55199 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms