Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms