Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms