Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MAP2K4P45985 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms