Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC1A1P43005 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms