Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZEB1P37275 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZEB1P37275 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZEB1P37275 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZEB1P37275 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZEB1P37275 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZEB1P37275 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ZEB1P37275 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZEB1P37275 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZEB1P37275 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZEB1P37275 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZEB1P37275 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms