Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms