Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms