Protein–RNA interactions for Protein: P30613

PKLR, Pyruvate kinase PKLR, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKLRP30613 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKLRP30613 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKLRP30613 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKLRP30613 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKLRP30613 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKLRP30613 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKLRP30613 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKLRP30613 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms