Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB2P29033 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB2P29033 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB2P29033 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB2P29033 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB2P29033 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB2P29033 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB2P29033 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB2P29033 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB2P29033 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB2P29033 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB2P29033 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB2P29033 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB2P29033 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB2P29033 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB2P29033 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB2P29033 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB2P29033 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB2P29033 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB2P29033 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB2P29033 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB2P29033 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB2P29033 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB2P29033 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB2P29033 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB2P29033 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB2P29033 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB2P29033 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB2P29033 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB2P29033 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB2P29033 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB2P29033 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB2P29033 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB2P29033 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB2P29033 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB2P29033 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB2P29033 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB2P29033 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB2P29033 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GJB2P29033 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GJB2P29033 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB2P29033 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB2P29033 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB2P29033 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB2P29033 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB2P29033 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB2P29033 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms