Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD34P28906 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD34P28906 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms